Melioracijos sistemų priežiūra ir tinkamas jų veikimas yra labai svarbūs siekiant užtikrinti tinkamą vandens valdymą bei užkirsti kelią potvyniams. Netinkama jų priežiūra ir neatsargūs gyventojų bei žemės savininkų veiksmai gali sutrikdyti visos sistemos veikimą.